香港大學校務委員會於10月27日（星期二）議決委任清華大學工業工程系主任申作軍教授為副校長（研究），清華大學理學院院長宮鵬教授為副校長（學術發展），以及傅華伶教授為法律學院院長，任期皆為五年。
清華大學校網曾顯示申作軍是工業工程系的黨委委員，即是中共黨員。港大校委會主席李國章就有關兩位副校長和一位學院院長任命的聲明：
李國章：校委會對有關兩位教授的相關議題的澄清表示滿意
遴選工作經由全球物色適當的人選，審視和諮詢過程詳盡嚴謹，其唯一的目的是為大學招攬最優秀的人才擔任領導職務。三位獲任命的教授，都是具國際聲譽，在其學術領域表現卓越的優秀學者。
由於近期就兩位副校長人選的背景有諸多傳聞和猜測，兩位教授特意作出澄清，包括候任副校長（研究）申作軍教授表明他不是共產黨員，也不是黨委成員。校委會對有關兩位教授的相關議題的澄清表示滿意，認為所有指控皆不成立。
申作軍澄清自己不是共產黨員和黨委成員
申作軍向校委會發信，澄清自己不是共產黨員和黨委成員：
Dear members of the council,
In the light of the recent news reports on my background, I would like to make a clarification as below.
I have been working full time at UC Berkeley starting from 2004 and my appointment in Tsinghua is only honorary with approval from Berkeley. Being the honorary department chair, I only spend a few weeks every year in Tsinghua and do not participate in the daily operations of the department. I am not a member of the Chinese Communist Party and I am also not in the party committee as claimed by the reports. It was an oversight by the webmaste of the respective website.
After I read the reports I immediately contacted Tsinghua and they have rectified all information about me on their websites. I later found out the error started several years ago when I, as the department chair, was mistakenly assigned to the party committee.
I hope this clarification can clear all misunderstandings between us.
Regards,
Max Shen
3名教授推薦申作軍出任副校長
消息人士透露，有3名教授推薦申作軍教授出任副校長。以下為他們對申教授的評價：
麻省理工學院工程系統教授David Simichi-Levi形容申作軍教授為該領域同齡人中能力最高的人：
- 「（申教授是）一位明星研究員……。 他具備三種品質：深入的研究、廣泛的興趣和辦法多多。」
加州大學洛杉磯分校傑出教授、《製造業與服務營運管理》編輯Christopher Tang：
- 「申教授對應用研究感興趣，他與阿里巴巴和京東等業界先進公司的互動，使他能夠驗證各種創新的研究思維。」
史丹福大學商學院托馬（Thoma）營運學、資訊與科技學教授李效良教授：
- 「申作軍教授通過他的研究和教學，以及他的影響，為我們的專業作出了傑出的貢獻。他是生產和營運管理領域一位具有很高知名度的頂級研究人員。他的研究能力一直是該領域中頂尖的，其研究質量一直是一流的。 」
- 「申教授研究的，都是行業存在的實際問題……。他幫助業界運用他的研究技能來改善營運。他幫助阿里巴巴開發了物流優化方案，並為京東的供應鏈團隊改善端到端的供應鏈管理。他不僅是一位能力強大的研究員，並且可以幫助業界修橋鋪路，使研究成果付諸實踐的人。」
- 「他是明星，他完全有資格在任何頂尖大學擔任講座教授。」
- 「他是（全球）運輸科學和智慧城市的十大研究人員之一。」
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