陳耀祖後來隨其姊夫投日。出於表忠，他露骨地鼓吹中日合作。他出任廣東省政府主席一職。在談到孫中山（1866-1925）遺訓時，他故意曲解孫中山的「大亞洲主義」等主張，斷章取義，以遂其政治意圖。1941年3月，他說「總理孫先生離開我們，到現在足足十六周年了」，「總理是為中國而生，是為亞洲而生，也是為世界而生。所以他的死，是中國的損失、亞洲的損失，也是世界的損失！」接着，他謂孫中山人雖死，卻留下了珍貴的遺產︰《建國方略》、《三民主義》、「大亞洲主義」，與及「天下為公」的主張。
根據他的理解，「三民主義」是救國的主義，沿着三民主義前行的國民革命，「是一個總名辭」；國民革命之中，有三重意義，實行時也分三方面，一是民族革命，二是民權革命，三是民生革命。民族革命是要促進中國國際地位平等；民權革命是要促進中國人民政治平等;民生革命是要促進中國人民經濟平等。陳耀祖解釋，辛亥革命僅是國民革命其中一個階段，包含了民族革命和民權革命二方面，從表面而言，「辛亥革命是改專制為民主，變國體為共和」，似是偏重在政治方面。
在這一點上，他借題發揮，說當時革命先烈的動機，其實「是為了中國百年來飽受歐美帝國主義的侵略，使中國變為次殖民地，而當時執政者之昏庸，政治不修，沒有能力抵抗，故為解除中國的次殖民地位起見，不能不推翻專制，先從改革中國的政治，以充實國力做起。」他的結論是，推翻專制只是手段，「抵抗歐美帝國主義才是目的」。陳耀祖是從根本歪曲事實1。孫中山等人組織革命，旨在推翻清政帝制，至於反抗「歐美帝國主義」，或許部分革命分子懷有這一思想，但顯非主流。陳氏所云不過是為戰爭服務、為日人所主張作宣傳，完全是一派通敵之言。
不斷鼓吹中日親善
同一年，東亞新聞記者大會在廣州召開。陳耀祖以主人家身份致歡迎辭。他再一次鼓吹「中日親善」。他謂大會「集中日滿三國新聞記者諸君於一堂」，認為是東亞新聞記者團結的表現，也是東亞同盟的文化溝通、建設「東亞新秩序」的表現。
他又稱頌發動侵華的日本，謂「反過來我們看看友邦日本」，「日本文化的歷史，雖然不及中國悠久，然而日本文化不獨能夠始終保持東亞文化的優點，而且能夠多方吸收世界文化，經過合理的消化，而育成為現代最優美的綜合文化」，又以恭順的語氣，請三國新聞界同仁對廣東文化努力檢討、加以批評；他承認廣東文化基礎薄弱，有待培養和扶植。他衷心希望三國新聞界同仁，能將各地優秀文化介紹進廣東，從而令廣東文化「足以成為東亞文化復興運動的支柱之一」2。由此可見，陳耀祖通敵程度之深。
1941年12月，日本軍全面向香港進攻。由當年的聖誕開始，香港進入了「三年零八個月」的艱苦歲月。在日本軍政統治底下，香港市民生活困苦；日本人為了減輕香港的人口壓力，遂鼓勵香港人歸鄉。廣東與香港僅一河之隔，而很多香港人也是粵人，因此他們的目的地自然是廣東。
1942年8月21日，時為廣東省政府主席的陳耀祖訪港，與香港總督磯谷廉介(1886-1967)中將會面。陳在香港發表談話謂︰
余頃巡視市內各處，見工商各業均已恢復，治安亦已確立，吾人對磯谷中將勵精圖治之苦心，深表敬意。廣東與香港僅一水之隔，實有互相協力之必要。關於人口過剩問題，廣東省政府方面盡量收容由香港回鄉之人民，以謀農地開墾及生產増強，然如何使彼等歸鄉及各項救濟方案，廣東及香港當局，自當共同負責。磯谷總督前此之訪廣州及余今次之答訪，即在互相認識當地之實情，以謀緊密之協力。廣東省政府已收容回鄉之華僑三、四十萬人，並支出二百萬圓為救濟費用。3
在陳耀祖的言談之中，並無半句譴責日軍對香港造成的巨大破壞。
1943年1月20日陳耀祖在上海廣東同鄉會作演講，向會上各人報告戰時廣東的情況。
他謂「廣東省政府成立以來，經過多年的改革，已得入正常狀態」。他將廣東的情況分三方面來說：
第一，是政治和軍警。他指出，廣東自組織政府之後，情況已轉為平穩，政治亦已入於正軌，「至於行政權及治安方面」，則「絕對自主」，又說「人民也均樂與友邦(按，日本)協力」。當時廣東省共有二個師及警察三萬人，其他地方自衛隊則有約一萬人。全省器械充足，可保全境安全。
第二，是經濟。陳耀祖謂「粵省經濟，在三年前至去年為止，完全採用軍票為本位，自去年1月份起，已完全改用中儲劵，但軍票亦可比率通用，與上海相彷。」至於廣東米價，以一百斤一擔計算，甲等米一擔國幣240元、乙等200元、丁等180元。另又實施計口授糧，大人一日十兩、六歲以下小孩一日六兩;辦法是由省政府根據統制糧食辦法，把香山等地產的米糧給價收購，再行分配給零售商，民眾憑購米證照上所開列價錢向米店購買米糧。在屋宇方面，「戰後省民四散分開，故無人管理的房屋，在廣州最多，省政府成立後，為防宵小拆賣，故立即組織民業管理委員會，將無主房屋妥為管理。」
第三，是教育與建設。陳耀祖報告，全省公私立中學共約35所，學生約8,000人；小學1,152所，學生165萬人；省立大學恢復，另有國立廣東大學，學生450人。他又指出，省政府積極推動建設工作。在戰後，日軍管理廣州等地所有工廠，但自省政府成立之後，「友邦方面先後將各廠全部交還」。自來水廠、士敏土廠、啤酒廠、糖廠等後亦陸續恢復，均有盈利；「化縣又在開煤礦，所產之煤質甚佳，將來當可大量生產」。然而廣東省交通仍是困難，上海與廣州之間交通有所隔膜，省內交通尚未暢通，為令物流便捷，預備利用帆船為工具，以疏導運輸。香港與廣州接壤，在港粵人甚多，香港難以容納，廣東省出錢出力「救濟港僑」，「由省府負責遣散約三十餘萬人」。4陳耀祖雖努力粉飾太平、歌頌日本，但亦難掩國土淪喪的滄桑。
觀古董賠上性命
1944年4月4日下午，陳耀祖「與衛士八、九人，往廣州文德路搜購古玩」，行刺者偵知其行蹤，乘其觀賞古物之際，「上前以快掣薄壳」向他施襲，陳連中數槍，幾名衛士亦中槍斃命。陳耀祖經送醫院治理，惟因受傷過重，返魂乏術，延至5日下午1時50分不治。5
陳耀祖的香港大學同窗、時為國府駐俄大使的傅秉常在俄京收聽英國廣播公司(British Broadcasting Corporation) 廣播得悉其死訊，在日記中云「余與彼同學多年，渠人本不錯，惜環境不佳，隨其姊丈同充漢奸，致有此結果，深為渠惜也。」6
傅秉常寥寥幾句，概括了陳耀祖匆匆的一生。
汪精衛妻舅陳耀祖的故事（二之二）
