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心房顫動的危險，在於會使血栓在心臟中形成，約有九成的血塊都形成於如指尖般大的左心耳這部位，這血塊若隨血液流入腦中，會阻塞腦血管導致腦動脈栓塞（中風）；若阻塞心臟中的血管，則會造成心肌梗塞。

花蓮慈濟醫院近年引進的冷凍氣囊消融術與電氣燒灼術在原理上略有不同，但目的都在消除肺靜脈中不正常的電氣反應，讓飽受心房顫動病苦多年的病人也有了新選擇。